Enzimas de restricción

Las enzimas de restricción son uno de los productos más empleados en genética actualmente. Son enzimas que reconocen una determinada secuencia de ADN (secuencias cortas 4-10 nt más o menos) y la cortan. Siempre reconocen la misma secuencia y siempre la cortan en el mismo sitio y de la misma forma. La mayoría de ellas son muy específicas, de modo que si en la secuencia cambia una sola base (letra) ya no la reconocen y no la cortan.

Las enzimas de restricción se extraen de bacterias, que las usan para defenderse de invasiones de ADN externo como los virus. Lo que sucede es que cada especie de bacteria tiene “preferencia” por tener en su genoma determinados tipos de secuencias. De manera que si entra en su citoplasma un ADN de otra especie tendrá “preferencia” por otras secuencias distintas. De forma que la bacteria tiene una enzima que corta el ADN en una secuencia que ella no posee, pero el ADN de otras especies sí lo tendrá, así que cuando entre lo cortará y ya no será un peligro.

En genética se aprovechan estas enzimas para cortar el ADN en zonas que queremos. De modo que podemos usarlas para cortar un plásmido y ponerle ahí la secuencia que nos interesa (los plásmidos se les meten a las bacterias cuándo queremos que conserven o amplifiquen por nosotros un fragmento de ADN), para hacer pruebas de ADN, para secuenciar…. Por nombrar sólo algunas de las aplicaciones.

¿Que cómo se pueden usar para estas otras cosas? Pues básicamente haciendo geles. A ver, os voy a poner un ejemplo que si no seguro que me lío y no me explico bien. Por ejemplo para identificar criminales cómo hacen en el CSI; cada persona tiene una secuencia de ADN única. Es similar a la del resto en cuanto a los genes que tienes y el orden y demás, pero hay pequeñas variaciones que al final acaban siendo un montón de variaciones (sólo son iguales los ADNs de los gemelos idénticos, y aún así no 100%). Si se usa un coktail de enzimas al final habrá muchos sitios en los que corten, y esos cortes no serán los mismos en dos personas distintas. Lo que hacen/hacemos es poner esos trozos de DNA en un gel de agarosa y separarlos por tamaño. La agarosa es un compuesto que crea una red tridimensional (al hacer el gel se dejan unos huecos o “pocillos” para poner la muestra), de modo que cuándo los fragmentos que se ponen tienen que atravesarla los trozos más pequeños se engancharán menos en la red y pasarán más deprisa. ¿Y qué se usa para hacer pasar el ADN? Pues electricidad. Los fragmentos de ADN tienen carga negativa, de modo que se someten a un campo eléctrico y correrán hacia el polo positivo. De esta forma se separan los distintos tamaños de ADN, que se ven como bandas, y cómo cada persona tiene unos fragmentos distintos cada persona tiene un patrón de bandas diferente. De modo que si en el lugar delito se ha encontrado un ADN que, comparando con el patrón de bandas de la víctima se sabe que no es suyo, posiblemente sea del delincuente (eso ya es cuestión policiaca). El caso es que si se compara el patrón de ADN de los sospechosos con el del delincuente que se encontró en la escena del crimen se puede ver si algún patrón coincide, y si es así… ya se puede ver en la cárcel.

Si la muestra marcada como E(vs) es la que se encontró en la escena del crimen ¿cuál creeis que es el criminal?¿el Sujeto1 o el Sujeto2?

Bueno, creo que por un día es bastante información, pero si el tema os interesa y quereis que os cuente cómo se usa para secuenciar o identificar enfermedades, o que profundice más en algo hacedmelo saber en los comentarios y pongo otra entrada.

Milagros

Me he encontrado esto por internet y no me resito a ponerlo aquí... me ha encantado.

Adornos navideños

El otro día, en un gran centro comercial de estos que tienen aquí, no pude resistirme a echarle un vistazo a los adornos navideños. La verdad es que en los comercios los tienen a la venta desde hace bastante tiempo, y en los escaparates desde que quitaron los de halloween. No me extraña que se vuelvan locos decorando, y es que hay algunos que son una verdadera pasada. Además me parecen super baratos. El winnie de pooh que tengo en la foto es de peluche pero se tiene en pié, y costaba sólo 15 $. ¡¡15$!! ¡Si un peluche de ese tamaño y encima de un personaje de Disney te puede costar mínimo 30 euros!! Las bolas de navidad de cristal, que son más caras que las típicas de plástico, a 1$... vamos que yo así también pondría la casa decorada hasta el tejado. Pero lo que más gracia me hizo fué este perro. Le sacamos un vídeo así que vedlo, por favor, porque yo me partía de la risa.

Arte fluorescente

Quería estrenar la imagen del blog con algo digno de mención. Pensaba hacer una entrada de las que suelo etiquetar como "enseñanzas", pero no sabía muy bien de qué y buscando me he encontrado con esta foto en el Museo de la ciencia, y me he dicho "Pero qué friki!!, esto tiene que ir al blog" (si, hablo conmigo misma, es una de las secuelas de pasar tanto tiempo sóla en el laboratorio). Así que aquí lo teneis, algún friki se ha entretenido haciendo un dibujo a base de cultivar en una placa de petri bacterias que expresan distintas proteinas fluorescentes. Jamás se me habría ocurrido...

Queeesoooo!

Señores, hoy soy felíz. Porque ayer encontré en una tienda queso español. Cuando lo he dicho a los americanos del laboratorio casi me matan, porque se supone que esta es tierra de quesos y tienen muchos tipos de queso y demas.... Mentira! tienen un queso y le ponen dentro cosas y dicen que es distinto. Además aquí todo el queso es de este sin curar, cómo el suizo o el queso de bola. Te lo venden en paquetes que no sabes si eso ha tenido corteza o no. Aquí un ejemplo. En fin, que dónde esté un queso español... o frances, ya me da igual. No voy a hablar más de las delicias de nuestro queso porque empiezo a salivar y mal. El caso es que encontré queso manchego, y del curado. Y también queso de Valdeón!!! Eso si me sorprendió, encontrarme por estos lares un queso de León! Total, que ya soy feliz. Si ahora fuera capaz de encontrar un jamón serrano en condiciones... Y es que que me perdonen los italianos pero aquí solo encuentro "prosciutto" y mas que a jamón sabe a sal y punto. No se si todos los jamones italianos serán igual pero... dónde esté un jamón español... de Teruel o del Sur, me da igual...

Farmer´s Market

Bueno, os voy a explicar mejor lo que es el mercado de los granjeros y sobre todo contaros las cosas raras que ahí he descubierto. Todos los sábados de buen tiempo (por desgracia este sábado ya es el último, que luego se supone que hace mucho frío), en el loop que rodea al capitolio (el edificio blanco ese de la cúpula) se pone el mercado de los granjeros o Farmer´s Market. Allí puedes encontrar sobre todo verduras y hortalizas (unas orgánicas y otras supongo que no porque no especifica), pero también bollería, pan (aunque nada que ver con el pan europeo), queso (que dicen que Wisconsin es tierra de queso), pasta... y algunos puestos de artesanía también. Es un buen plan para el sábado por la mañana y los precios de algunas cosas no están mal. Además en ocasiones es bonito ver todas las patatas, los pimientos, las calabazas o el maíz.... Pero sobre todo quiero enseñaros algunas verduras que yo no conocía, igual alguno de vosotros sí, pero me han resultado curiosas: Las patatas azules: aquí las teneis, por fuera son oscuras y si les quitas la tierra son moradas, pero lo más increible es que son azules por dentro también!!! Bueno, quien dice azules dice moradas, y al hervirlas dejan el agua verde... es una cosa muy rara pero están buenas. La verdad es que no sé la razón de su color, porque las hay rojas y amarillas, pero sólo por fuera, es la primera vez que las veo con color en el interior. Los pimientos de chocolate: son estos pimientines marrones que teneis aquí (en la realidad se ven ciertamente color chocolate). No los he probado pero dicen que saben dulces. Las coliflores moradas: aquí las teneis junto al brocoli romanescu (este también es raro pero ya lo había visto en España). No son moradas sólo en la superficie, todo por dentro, lo que en las otras coliflores es blanco, es morado en estas. También las tengo pendientes de probar pero espero que caigan este fin de semana.La naranja de Osange: o algo así... Esta no se come, no os asusteis, pero es un repelente natural de los insectos... Yo nunca la había visto pero ha sido verla en el mercado y ahora me la encuentro en los juegos de ordenador estos de buscar objetos en habitaciones desordenadas... Casualidad? será que antes no sabía lo que era... Bueno, de momento eso es todo lo raro que he visto en el mercado, pero quería poneros también esta foto de los maices con los granos de colores (que a mi siempre que las veo me recuerdan a las prácticas de genética) y esas mini-mazorquitas moradas que tan graciosas me parecieron. Espero que os guste y ya me contareis si conocíais algo de esto antes.

Día de Elecciones

¿Qué cómo se han vivido aquí las elecciones? a lo grande como todo. Mira que yo no tengo tele ni radio y por tanto no me pueden bombardear con anuncios de la campaña presidencial... pues es lo mismo, porque además de los carteles posters y pegatinas te encuentras con mil voluntarios por la calle para decirte que votes. Desde que llegué estoy viendo un montón de sitios dónde te podías registrar para votar (porque no vale con estar en el censo, tienes que registrarte). Yo creo que lo más importante para ellos es que votaras (si votabas a Obama mejor, claro) pero he visto carteles animando a votar por todas partes. Y ayer ya ni te cuento. Escrito con tiza en el suelo, los autobuses alternaban en los rótulos el nombre de la ruta con "vote today", la gente con pegatinas de "I voted" (he votado)... Incluso en algunos establecimientos regalaban cosas, como café en Starbucks o helado en Ben & Jerrry´s (lo que no se es si a todo el mundo o sólo a los que habían votado). En cuanto a la campaña... ni que decir tiene que esto es territorio de Obama, que para algo estamos junto a Chicago. Además creo que Madison es democrata de siempre. Así que si ibas al mercado de los granjeros te encontrabas a gente gritando que votaras por Obama y fuera Mc Cain, por la calle gente que daba o vendía (eso no lo se) chapas y pegatinas, pegatinas en los coches, calabazas de halloween con el logotipo de Obama (está en el vídeo), carteles en los jardines de las casas... Lo que sí que es cierto que cuando salías de la ciudad se veían menos carteles de Obama y más de Mc Cain. Y bueno, anoche un jaleo tremendo, los coches pitando, la gente jaleando.. porque ha ganado Obama (y aquí ese jaleo no es tan normal como en España). Aunque según gente como mi jefe de aquí estaba claro, no sólo por los sondeos sino porque el lunes los Redskins perdieron. Me explico; desde 1936 (cuando los Redskins estaban todavía en Boston, que ahora están en Washington) este equipo de futbol americano ha predicho los resultados de las elecciones. Si en el último partido en casa antes de las elecciones los Redskins ganan, las elecciones las gana el partido que está actualente en la Casa Blanca, y si pierden las gana el otro partido. Pues bien, este año los Redskins eran claros favoritos para ganar el partido, porque la estrella del otro equipo (Pittsburgh Steelers) no podía jugar.. pero sorprendentemente perdieron... Así que le tocaba ganar a Obama y Obama ganó... Curiosa superstición... Bueno, ya sabeis que podeis preguntar lo que querais.

Halloween!! (3º parte)

Finalmente aquí os cuelgo el vídeo con las fotos de Halloween. Es un poco largo pero es que como comprendereis hay muchas cosas que retratar (y debo reconocer que me encantan las calabazas).

Me ha costado más de lo que pensaba porque había montado un vídeo muy chulo con la canción "Esto es Halloween" de "Pesadilla antes de Navidad" y quedaba muy bien, pero al irlo a subir al youtube me ha dicho que había problemas con el copiright así que no me arriesgo y la he cambiado (aunque no quede tan bien). Espero que os guste... Mañana ya os cuento sobre las elecciones

Halloween!! (2º parte)

Pues ya he podido disfrutar de Halloween, y ha sido muy divertido. El viernes estuve dando una vuelta por los barrios para ver la decoración de las casas. La verdad es que depende mucho del barrio al que vayas. Parece que la crisis también se nota en esto porque ví menos decoración de la que esperaba, pero algunas eran realmente chulas (a ver si monto un vídeo con las fotos y os lo subo). Pudimos ver a los niños pidiendo caramelos y la verdad es que se veía que se lo estaban pasando pipa. Y la diversión para los mayores llegó el sábado, que cerraron una calle entera para hacer una Mega-fiesta, con conciertos, pinchadiscos... y casi todo el mundo disfrazado. Además hubo suerte porque el tiempo acompañó, y aunque a media noche ya hacía bastante fresco, no hizo falta ponerse el abrigo encima del disfráz. ¿El premio al más friki? Se lo disputan entre el que iba disfrazado de fago lambda y el del Moustro del Espaguetti Volador (al que ya conoceis todos), vosotros que pensais? La verdad es que estos americanos saben montar fiestas y preparar disfraces. Lo gracioso fue que la gente nos pedía hacerse fotos con nosotras!!! y eso que cogimos el disfráz sólo por no ser de las pocas sin disfrazar... en fin. Si venis a EEUU teneis que probarlo.