miércoles, julio 08, 2009

Se que os tengo un poquito abandonados.. ya lo siento, pero es que esto de que parezca que sí, que te salen las cosas, pero luego no , pero si, pero no... es un poco desesperante... Lo primero diré que finalmente sí que voy al congreso de la SEG de Málaga, así que los que vengais decidmelo para buscarnos o algo!!! Y por lo demás sigo un poco como siempre, con las ChIPs, transformando bacterias (metiendoles los trocitos de ADN para que los guarden y hagan más copias) e intentando secuenciar. Y digo intentando porque se me resiste.. y no entiendo ya por qué. Os explico; sabeis que el ADN es una doble hélice, compuesta por dos cadenas que son complementarias entre sí, y se unen formando la cadenita típica. Pues para secuenciar normalmente se secuencian las dos cadenas: por un lado una y por el otro lado la otra. Partiendo de la misma muestra se puede mirar por separado una y otra y luego las juntas para ver que efectivamente son complementarias... pues no sé por qué, consigo secuenciar en uno de los sentidos pero en el otro no hay forma... y es la misma muestra, que si fuera que está mal no saldría en ningún sentido, pues no... Yo ya no se si es el espíritu del doctorando que nunca acabó la tesis o qué, pero me estoy volviendo loca... Bueno, espero no abandonaros tanto tiempo esta vez... aunque se acerquen las vacaciones (qué ganas de pillarlas)

martes, junio 09, 2009

Roche LightCyler 480

estos de las casas comerciales están cada vez peor.... no, no es la nueva película de pixar...

lunes, junio 01, 2009

ChIP y más

Bueno, pues ya he hecho mi primera ChIP en España, y estoy contenta porque ¡¡Me ha salido!!! jejejeje... la verdad es que estoy muy contenta porque cambiaban muchas cosas y no las tenía yo todas conmigo, pero vamos... que salió. Y aquí os dejo para vuestras risas y deleite la última "frikez" de los de BioRad. Hace un tiempo os puse la canción que le habían dedicado a la PCR. Pues bien, esta es la segunda parte. Lo peor de todo es que una va navegando por el youtube y ve cada cosa...

martes, mayo 05, 2009

al fin resultados

Hola a todos, hoy escribo mucho más contenta, y es que al fin, despues de casi 3 años, estoy obteniendo resultados de mi tesis, que entre que me han entretenido con otras cosas y demás...
La ChIP que hice en EEUU (ahora ya sabeis lo que es la ChIP, jejeje) está dando sus frutos y ya estoy obteniendo algunas secuencias nuevas. Además estoy trabajando ahora con fósforo radiactivo, marcando ese mismo ADN, y aunque eso sí que son resultados muy preliminares y tendré que repetirlo, parece que va saliendo y que no da tantos problemas cómo acostumbra. Así que quería compartir mi alegría con vosotros, que una ya empezaba a agobiarse con eso de ver cerca el final de la beca. Este mes ya estoy de contrato, lo que significa que tengo ya sólo dos años. Para los que no esteis puestos las becas pre-doctorales, ahora mismo, son dos años de beca y dos de contrato. Fue un gran avance ya que esos dos años de contrato ya cotizas y luego tienes derecho a paro y demás... bueno pues eso, era sólo compartir mi esperanza

lunes, abril 20, 2009

hasta las narices de las falacias informativas

El otro día viendo el telediario ví la noticia de la manifestación contra los transgénicos que hubo en Zaragoza y me revolví en el sofá sólo de oir lo que decían, al final tuve que cambiar de cadena a media noticia... El caso ya rozó lo irrazonable cuándo ví a gente quejarse porque quería tener un cultivo ecológico y se lo había contaminado el del campo de al lado que había puesto el cultivo transgénico porque "no se puede controlar dónde va el polen". ¡¡¡¡Por favor!!!! Informese un poquito antes de hablar! Una de las condiciones imprescindibles que tiene que cumplir un transgénico para salir al mercado es que el polen sea estéril, precisamente para evitar estos problemas de contaminación al medio. Por eso mucha gente se queja de que claro, que las semillas que producen no son fértiles.. es que si se cae la semilla al campo de al lado y crece también lo contaminaría... En fín, que si os interesa el tema hacedmelo saber y os busco y explico los requisitos que deben cumplir los transgénicos, pero, por favor, no os creais lo que dicen en la tele. PD.- si alguien sabe una forma sencilla (que con el html no me aclaro) para conseguir que esto me respete los puntos y a parte, lo agradecería

sábado, abril 18, 2009

looking for the anther

Ya que las anteras me están quitando tanto tiempo y casi no puedo escribir aquí, he decidido mostraros a todos cómo es lo que estoy haciendo. Mi día comienza en el invernadero, dónde tenemos unas 300 plantas de distintas líneas y variedades. Aquí tenemos que ir planta por planta mirando a ver cómo es el tamaño de las espigas para ver las que están en una etapa propicia para cogerlas. Las espigas que nosotros queremos son aún pequeñas y no asoman por encima de las hojas, están aún dentro, de modo que hay que ir tocando los hijuelos para notar su posición y tamaño. Es un engorro porque son muchas plantas y además algunos días crecen mucho de un día para otro. Luego cortamos esos hijuelos y los llevamos al laboratorio en una botella de agua. Por supuesto etiquetamos el nombre de cada planta, porque como ya os digo tenemos muchas líneas y variedades distintas. Esa foto que os he puesto era de un día en que por suerte teníamos poco.... Luego hay que abrir la hoja del hijuelo y ahí está la espiguita, como veis aún es pequeña, pero ese es el tamaño que nosotros andamos buscando. De hecho esta era un poco grande, pero para enseñaroslo es más fácil así. Cogemos la espiga y la colocamos en una placa Petri con papel de filtro húmedo para que no se seque y ahí, debajo de la lupa binocular, es dónde vamos a abrir las flores para ver las anteras. Hay algo que nos facilita un poco la búsqueda, y es que las espigas tienen un gradiente de maduración, de manera que las flores que hay en el centro de la espiga están más maduras y las que hay hacia los extremos progresivamente menos maduras (o al menos en teoría porque a veces hacen lo que les da la gana). Las fotos que os muestro a partir de ahora no están tan bien, pero es que las hice a través del ocular de la lupa con mi cámara, porque no tenemos cámaras de fotos acopladas a las lupas, así que siento lo del círculo rodeado de negro. En esta se ve la espiga más de cerca (cuando se mira directamente el campo es más amplio y es más fácil). Se ven cada una de las "cosas" a los lados de la espiga, y digo "cosas" porque aunque se podría pensar que son flores realmente son inflorescencias, porque ahí, en cada una, hay 3 o 4 florecitas. En esta imagen he abierto la inflorescencia, de modo que ha quedado una flor a la derecha, otra a la izquierda y otra en el centro. Como veis crecen como si estuvieran unas dentro de otras, y la de más afuera es más madura, la siguiente de más adentro un poco menos y la de más adentro menos. Esto también ayuda a saber un poco qué flor es la que andamos buscando. Luego, cuándo abres la flor y le quitas los pétalos (que en gramíneas se llaman glumas) te encuentras con las 3 anteras (partes de la flor dónde se forma el polen) y el gineceo (parte de la flor que recibe el polen y dónde se forman las ovocélulas). Lo que nosotros queremos son las anteras, puesto que, como en todo ser vivo, la meiosis masculina es más fácil de estudiar que la femenina. Como cada flor tiene 3 anteras y se supone (que luego no siempre) que son sincrónicas (es decir, que todas han crecido a la vez y están en la misma fase), cogemos una de las anteras de la flor, la teñimos y la "espachurramos" entre un porta y un cubre para mirar las células al microscopio, y si están en la fase que queremos guardamos las otras dos anteras en fijador para los experimentos, y si no las tiramos. Pues en esto me paso los días desde hace ya casi un mes... y no se lo que me falta pero espero que no mucho porque mi espalda, mis ojos y mi paciencia ya no se si dan para mucho más. Bueno, para que veais que el trigo sí tiene flores (aunque son muy feas) y entendais un poco más a qué me dedico. Ya me contareis qué os parece... besos

sábado, abril 04, 2009

sin vacaciones

Y es que las plantas no entienden de fiestas ni días de guardar... Ya podrían pero no.... Yo entiendo que a las plantas no les ponen un calendario, y entonces se guían por el fotoperiodo y los ciclos lunares, y claro, como la Semana Santa también va conforme a los ciclos lunares, pues me quedo sin vacaciones, porque mis plantas siempre están en la época idónea para ser recogidas en Semana Santa.... Y es que tengo el trigo formando polen a más no poder, y cómo yo necesito esa división que luego da lugar al polen... pues a quedarse sin vacaciones. Lo peor no es eso, es tener que venir tooodos los días y pasarse las horas entre lupa y microscopio... y claro, tengo la espalda... pero bueno. Por todo ello os digo que intentaré sacar tiempo para escribir, pero no puedo prometer nada... Pasad buenas vacaciones los que podais...

domingo, marzo 29, 2009

ChIP

Hola de nuevo. Siento haberos dejado tanto tiempo y ya he tenido reproches por ello así que intentaré compensaros en un futuro. Sé que tengo un par de temas pendientes, pero hoy me parece más oportuno contaros un poco sobre la técnica que me tiene tan liada últimamente, la ChIP (inmunoprecipitación de cromatina). Esta técnica se basa en la capacidad que tienen los anticuerpos de reconocer específicamente un tipo de molécula. Los anticuerpos son parte de las defensas de los animales, algunos glóbulos blancos los producen y los anticuerpos se unen a la molécula extraña inutilizandola y marcandola para que actúen el resto de defensas. Cada tipo de anticuerpo reconoce un tipo determinado de molécula, por lo que se utilizan mucho en biología para marcar o detectar ciertas moléculas. Así, por ejemplo, si queremos saber dónde se sitúa una proteína en una célula usamos un anticuerpo contra esa proteína, que además tenga unido una molécula fluorescente y así luego lo podemos ver al microscopio. La ChIP lo que hace es usar los anticuerpos pero de otra manera. La palabra inmunoprecipitación viene de que al ser los anticuerpos parte del sistema inmune también se conocen como inmunoglobulinas, así que ya os podeis imaginar que vamos a usar los anticuerpos para hacer que algo precipite o caiga al fondo. Lo que hacemos es coger todo el ADN de un montón de células, con proteinas y todo (porque el ADN, para ser estable y cumplir sus funciones, está unido a un montón de proteínas). Luego cortamos ese ADN o cromatina en trocitos pequeños y le añadimos el anticuerpo. Las proteínas que estan unidas a las distintas partes del ADN son diferentes según la estructura, función, etc del ADN, de modo que si usamos un anticuerpo contra una proteína asociada con una función concreta marcaremos sólo el ADN que cumpla esa función. En mi caso uso un Anticuerpo contra una proteína que sólo está en el centromero. Cuando ponemos el anticuerpo este reconocerá las proteínas concretas. Luego usamos un producto (carísimo por cierto) que se llama sefarosa y que se une a los anticuerpos. Este producto pesa mucho, de manera que si luego centrifugamos un poco ese producto, junto con el anticuerpo, la proteína a la que reconoce y el ADN unido a ella, van a precipitar al fondo del tubo. Luego se coge este fondo se purifica el ADN y así podemos luego trabajar con él y ver qué hay ahí.

Esta técnica no es muy dificil, pero es un poco liosilla y requiere mucha preparación previa. Por eso me está llevando mi tiempo comprar todo lo necesario para nuestro laboratorio y ponerla a punto. Pero espero que me de buenos resultados y pueda obtener así muchos datos para mi tesis. Como siempre si algo no os queda claro preguntad. He intentado simplificar, pero igual lo he hecho mucho o me he dejado alguna cosilla.

jueves, enero 22, 2009

En España

Hola a todos! Siento mucho esta larga ausencia, pero primero me fuí a casa de mis padres al volver de EEUU (y allí no tengo internet), y ahora estoy de vuelta en el laboratorio y tengo mogollón de curro. Mi compañera becaria está escribiendo su tesina así que tiene ocupado el ordenador todo el día (y lo compartimos), y yo me paso el día trabajando así que llego tarde a casa. Quería un gran post de año nuevo, pero no tengo tiempo de buscar la información, así que os tendreis que conformar con esto, porque de lo contrario voy a tardar mucho en actualizar, me temo. El caso es que nadie ha estado trabajando en el laboratorio en los tres meses que he estado en EEUU, así que hay muucho trabajo retrasado por hacer, y a quién creeis que le toca? pues a la menda. Lo bueno es que como ya os he explicado cosas os puedo contar que me paso el día entre FISHes, PCRs, geles de agarosa y enzimas de restricción... Pero bueno, intentaré sacar tiempo para contaros lo prometido: las aplicaciones de la PCR y las enzimas de restricción en el diagnóstico de enfermedades genéticas. Besos a todos

miércoles, diciembre 10, 2008

PCR

Prometo seguir con los usos de las enzimas de restricción, pero primero quiero explicaros la PCR, pues una técnica muy importante y en muchos casos se usa en lugar de las enzimas... Es una de las técnicas más usadas en biología molecular y se usa para amplificar fragmentos concretos de ADN u obtener más cantidad de ADN cuando tenemos muy poco. PCR son las siglas de Polymerase Chain Reaction (Reaccion en cadena de la Polimerasa). Se llama así porque se basa principalmente en la acción de esta enzima, la polimerasa. La DNA polimerasa es una enzima que, basicamente, lo que hace es crear cadenas de ADN. Pero no lo hace al azar, lo que hace es, usando una cadena de ADN (una cadena sóla, no la doble hélice) va creando la cadena complementaria. Para ello también necesita que primero halla un fragmentito de doble cadena, lo que como vereis nos va a ser muy útil. La enzima más usada es la Taq-Polimerasa, llamada así porque se extrae de una bacteria llamada Thermus aquaticus (que, como su nombre indica, vive en aguas calientes), y que es capaz de funcionar a una alta temperatura (sobre 70ºC) y soportar sin degradarse temperaturas aún mayores. Vale, os explico por qué nos resulta útil que necesite un fragmentito de doble hélice. Si nosotros tenemos un ADN (en doble hélice) y lo sometemos a calor (más de 90ºC, que nadie se asuste), lo que hacemos es desnaturalizarlo (es decir, separar las dos cadenas). Una vez que las tenemos separadas, si bajamos la temperatura las cadenas volveran a unirse, pero si por ahí tenemos unas pequeñas cadenitas complementarias se unirán antes, porque hay menos bases (letras) que aparear. Antes de seguir aquí quiero hacer un inciso, pues aunque para algunos puede ser claro no se si todo el mundo lo sabe; cuando las bases aparean lo hacen de una forma concreta, de modo que las Cs sólo se unen con las Gs y las As sólo se unen con las Ts, por esto es por lo que se habla de cadena complementaria, porque para una secuencia AACT la complementaria (que pondremos justo debajo) será TTGA. De modo que cuándo antes he dicho que la polimerasa coge una cadena como molde para hacer otra lo que hace es que si ve una T pone una A, si ve una A pone una T, si ve una G pone una C y si ve una C pone una A. Una vez aclarado esto (lo siento por los que ya lo supieran) sigo con los fragmentitos. Estos pequeños fragmentos los ponemos nosotros, y se llaman cebadores o primers. Tienen unas 20 bases y se pueden pedir a las empresas con la secuencia que nosotros queramos. Los ponemos en la mezcla y al bajar la temperatura se unirán al ADN que teníamos allí dónde encuentren la secuencia complementaria. De ese modo tenemos una gran molécula de ADN de cadena simple (el que no está en doble hélice) y una pequeña parte de doble cadena. La polimerasa reconocerá esto y se unirá ahí, empezando a formar más cadena complementaria a la que teníamos (también quiero aclarar que la polimerasa sólo crea cadena en una determinada dirección, de manera que sabemos hacia dónde va a crear la nueva cadena. Así que poniendo un primer en cada dirección podemos delimitar la región que queremos amplificar. De esta forma, usando un aparato que llamamos Termociclador, sometemos el ADN a distintas temperaturas para que la cadena se desnaturalice, se unan los primers y luego actúe la polimerasa. Luego otra vez se desnaturaliza, se unen los primers y actúa la polimerasa.... Por eso el aparato se llama termociclador, porque usa ciclos de temperatura. Así obtenemos la misma cadena muchas más veces (aumenta exponencialmente con el número de ciclos) y además sólo de la región que queremos (porque la primera ronda puede que amplifique más, pero luego se va a restirngir a nuestra zona) Este es un vídeo muy bonito que he encontrado en el Youtube sobre la PCR, pero allí podeis encontrar muchos mas, incluido este que tiene los subtítulos en castellano. Me había planteado haceros un vídeo, pero habiendolos tan buenos en la red creo que es tontería, porque seguro que a mi me queda peor... Espero que os haya quedado claro, si no no dudeis en preguntar. Otro día os explico aplicaciones que si no me va a quedar un post muy largo... Lo que si os quiero poner es este vídeo de BioRad... para que veais lo importante que es para nosotros la PCR que le han hecho una canción...

Llegó la nieve

Yo ya creí que me iba a marchar de aquí sin ver mas que un poco de nieve en las aceras... pero nó! Al volver de Nueva York me encontré con todo Madison nevado. Se supone que daban tormenta de nieve, pero yo tampoco lo llamaría así, nevar nevaba pero no era para tanto... Lo que más me impresionó fue ver TODA la calle blanca... hasta las aceras y las carreteras, y la gente andando y conduciendo como si tal cosa.. bueno, como si tal cosa no, que al taxi se le fue un poco el culillo un par de veces.. pero vamos, si cae una así en Madrid no me veo yo a los autobuses en la calle como aquí... Si que os diré que hoy, que anoche ya no nevaba, las calles habían vuelto a la normalidad y habían quitado la nieve de carreteras y aceras (de hecho creo que te multan si no quitas la nieve de la acera de tu casa). Pero la verdad es que fue bonito...

martes, diciembre 09, 2008

Nueva York

De Nueva York es dificil decir algo que no se haya dicho ya, pero es que es impresionante... La ciudad es bonita, pero la verdad es que lo que más me ha impactado es estar allí (y eso no se puede transmitir con las fotos). La tranquilidad de pasear por Central Park después de haber estado en la vorágine de la 5ª avenida, o Times Square... Eso sí, muchos turistas por todas partes, aunque ya tenía yo ganas de oír el español sin acento latino... y muchiiisima gente, sobre todo en Times Sq y el Rockefeller center... Eso sí, pudimos ver el árbol de navidad, la pista de hielo, y hasta una petición de mano en medio de la pista... un espectáculo. Las vistas desde lo alto del Empire State o del Top on the Rock impresionantes, eso sí, un frio... y es que la temperatura no estaba mal del todo (entre 0 y -6C) pero con el viento que hacía... Si tengo que escoger un edificio me quedo con el Chrisler de todas todas. No será el más alto, pero a mí me parece el más bonito. La Estatua de la Libertad la vimos desde el ferry gratuíto que va a Staten Island (porque no se puede entrar ahora, y para eso mejor no pagar...). La verdad es que me la esperaba más grande... pero es bonita, sobre todo cuándo se piensa en lo que significa y ha significado para muchas personas. El mítico puente de Brooklin también es algo que no puedes dejar de ver... impresiona ir por tu caminito de madera y ver entre las tablas los coches, la playa, o el río... Contaría muchas cosas y pondría muchas fotos, pero me temo que os aburriría así que os dejo con esta vista de la estatua de la libertad que me gusta especialmente.

martes, diciembre 02, 2008

Arboretum

Este fin de semana era largo y tocaba hacer un poco de turismo, así que fuimos al Arboretum de la UW (university of Wisconsin). Es un sitio que tienen para refugio de aves nativas. Está bastante bien, lo tienen preparado para hacer esquí de fondo en invierno, pero cuándo no es invierno también se dan paseos placenteros. De entre las cosas mas curiosas o divertidas destaco 3: - Vimos pavos salvajes!! (o silvestres... nunca sé cómo traducir "wild"). Eran enormes... yo no creí que los no cebados fueran tan grandes... Además me dijeron que, aunque no les gusta, vuelan. Madre mía, con la tripota que tienen y lo grandes que son... yo creí que eran como las gallinas, que no vuelan.. - El lago estaba helado!! Vale que no es el lago más grande de Mádison, pero impresiona ver un lago (que es grande) con toda la superficie helada. Aún no se puede andar encima pero con el tiempo que esta haciendo dentro de poco se podrá. - La curiosa manera que tienen de controlar al Álamo temblón. Tienen praderas que quieren conservar como tal y el álamo temblón es muy invasivo. Normalmente a los árboles se les controla con fuego, pero por el peculiar sistema de raíces que tiene el álamo esto sólo les hace crecer más. De modo que lo que hacen es quitarle la corteza en un aro todo alrededor. Al quitarles la corteza te llevas con ello los vasos del floema que están activos ese año (el floema son los vasos que llevan los nutrientes desde las hojas hasta el resto de la planta), de forma que las raíces no reciben nutrientes y el árbol muere. En fin, un sitio que merece la pena.

lunes, diciembre 01, 2008

Thanksgivings

Como todos me habíais dicho tanto sobre que os tenía que contar del día del pavo y tal he hecho los deberes, y no he ido a una cena... HE IDO A DOS!! Madre mía mi pobre estómago. Para ser honesta en la segunda casa apenas comí... no debería haber comido, pero es que tenía todo una pinta... Me plantan delante un salmón de más de medio metro hecho a la brasa... y claro, yo que llevo sin comer pescado una eternidad... Bueno que me lio, os cuento. Primero fuimos a la casa del jefe de una amiga. Sí, cosa rara, pero le debe gustar invitar a los extranjeros para que conozcan como es thanksgivings y me invitó también a mí. La verdad es que genial, todo con una presentación increible y con cartelitos para que supieramos lo que era cada cosa. La "cena" fue como a las 2 y pico de la tarde, así que más que cena fue comida.. Pero, además de un pavo de más de 12kg, había relleno de dos tipos (para vegetarianos y no), que nó sé por qué lo traducen como relleno si no lo meten en el pavo, aquí es "Dressing". También había puré de patatas, puré de patatas dulces con malvavisco, calabacin de espaguetti (creo que es como la calabaza de hacer cabello de ángel pero cocinado de otra forma), dos tipos de salsa de arándanos, otro tipo de calabaza... seguro que me dejo algo. Y luego los postres: tarta de calabaza (buenísima por cierto), tarta de manzana, tarta de coco, tarta de zanahoria y "madeleines" que es una especie de bizcochos franceses que hicimos mi amiga (que es francesa) y yo para llevar. El caso... hasta las cejas... Nos explicó que lo típico, al menos en su casa, es eso, juntarse con la familia y amigos al mediodía, comer, luego estar charlando tomando café (al fín un café bueno, por cierto), ver el partido de futbol (americano) y volver a comer... Pero vamos, que tienen sobras para una semana. Y lo del sandwich de pavo para comer en el trabajo el viernes también es típico (lo digo por los fans de Friends.. ya sabrán a qué me refiero). En fin, que por si no fuera poco Sylvie (la francesa) me dijo que la dueña de su casa organizaba cena con más gente del laboratorio y que fuera yo también despues... pues llegamos justo cuándo iban a trinchar el pavo y empezar a comer. En esta casa no os puedo decir todo lo que había porque creo que ni lo vi todo... pero vamos... pavo, salmón, patatas asadas, esparragos trigueros, paté de pescado... y mas cosas que no se qué eran... Y de postres ni os cuento que creo que ya os estoy poniendo los dientes bastante largos. La verdad es que me lo pasé muy bien, ya le estoy cogiendo el tranquillo a esto de entender el inglés con jaleo de fondo... Bueno, se despide hasta prontito la enviada especial a los estados juntitos... Os dejo con esta divertida imagen... a mi me hizo reir.

lunes, noviembre 24, 2008

Enzimas de restricción

Las enzimas de restricción son uno de los productos más empleados en genética actualmente. Son enzimas que reconocen una determinada secuencia de ADN (secuencias cortas 4-10 nt más o menos) y la cortan. Siempre reconocen la misma secuencia y siempre la cortan en el mismo sitio y de la misma forma. La mayoría de ellas son muy específicas, de modo que si en la secuencia cambia una sola base (letra) ya no la reconocen y no la cortan.

Las enzimas de restricción se extraen de bacterias, que las usan para defenderse de invasiones de ADN externo como los virus. Lo que sucede es que cada especie de bacteria tiene “preferencia” por tener en su genoma determinados tipos de secuencias. De manera que si entra en su citoplasma un ADN de otra especie tendrá “preferencia” por otras secuencias distintas. De forma que la bacteria tiene una enzima que corta el ADN en una secuencia que ella no posee, pero el ADN de otras especies sí lo tendrá, así que cuando entre lo cortará y ya no será un peligro.

En genética se aprovechan estas enzimas para cortar el ADN en zonas que queremos. De modo que podemos usarlas para cortar un plásmido y ponerle ahí la secuencia que nos interesa (los plásmidos se les meten a las bacterias cuándo queremos que conserven o amplifiquen por nosotros un fragmento de ADN), para hacer pruebas de ADN, para secuenciar…. Por nombrar sólo algunas de las aplicaciones.

¿Que cómo se pueden usar para estas otras cosas? Pues básicamente haciendo geles. A ver, os voy a poner un ejemplo que si no seguro que me lío y no me explico bien. Por ejemplo para identificar criminales cómo hacen en el CSI; cada persona tiene una secuencia de ADN única. Es similar a la del resto en cuanto a los genes que tienes y el orden y demás, pero hay pequeñas variaciones que al final acaban siendo un montón de variaciones (sólo son iguales los ADNs de los gemelos idénticos, y aún así no 100%). Si se usa un coktail de enzimas al final habrá muchos sitios en los que corten, y esos cortes no serán los mismos en dos personas distintas. Lo que hacen/hacemos es poner esos trozos de DNA en un gel de agarosa y separarlos por tamaño. La agarosa es un compuesto que crea una red tridimensional (al hacer el gel se dejan unos huecos o “pocillos” para poner la muestra), de modo que cuándo los fragmentos que se ponen tienen que atravesarla los trozos más pequeños se engancharán menos en la red y pasarán más deprisa. ¿Y qué se usa para hacer pasar el ADN? Pues electricidad. Los fragmentos de ADN tienen carga negativa, de modo que se someten a un campo eléctrico y correrán hacia el polo positivo. De esta forma se separan los distintos tamaños de ADN, que se ven como bandas, y cómo cada persona tiene unos fragmentos distintos cada persona tiene un patrón de bandas diferente. De modo que si en el lugar delito se ha encontrado un ADN que, comparando con el patrón de bandas de la víctima se sabe que no es suyo, posiblemente sea del delincuente (eso ya es cuestión policiaca). El caso es que si se compara el patrón de ADN de los sospechosos con el del delincuente que se encontró en la escena del crimen se puede ver si algún patrón coincide, y si es así… ya se puede ver en la cárcel.

Si la muestra marcada como E(vs) es la que se encontró en la escena del crimen ¿cuál creeis que es el criminal?¿el Sujeto1 o el Sujeto2?

Bueno, creo que por un día es bastante información, pero si el tema os interesa y quereis que os cuente cómo se usa para secuenciar o identificar enfermedades, o que profundice más en algo hacedmelo saber en los comentarios y pongo otra entrada.

viernes, noviembre 21, 2008

Milagros

Me he encontrado esto por internet y no me resito a ponerlo aquí... me ha encantado.