Se que os tengo un poquito abandonados.. ya lo siento, pero es que esto de que parezca que sí, que te salen las cosas, pero luego no , pero si, pero no... es un poco desesperante... Lo primero diré que finalmente sí que voy al congreso de la SEG de Málaga, así que los que vengais decidmelo para buscarnos o algo!!! Y por lo demás sigo un poco como siempre, con las ChIPs, transformando bacterias (metiendoles los trocitos de ADN para que los guarden y hagan más copias) e intentando secuenciar. Y digo intentando porque se me resiste.. y no entiendo ya por qué. Os explico; sabeis que el ADN es una doble hélice, compuesta por dos cadenas que son complementarias entre sí, y se unen formando la cadenita típica. Pues para secuenciar normalmente se secuencian las dos cadenas: por un lado una y por el otro lado la otra. Partiendo de la misma muestra se puede mirar por separado una y otra y luego las juntas para ver que efectivamente son complementarias... pues no sé por qué, consigo secuenciar en uno de los sentidos pero en el otro no hay forma... y es la misma muestra, que si fuera que está mal no saldría en ningún sentido, pues no... Yo ya no se si es el espíritu del doctorando que nunca acabó la tesis o qué, pero me estoy volviendo loca... Bueno, espero no abandonaros tanto tiempo esta vez... aunque se acerquen las vacaciones (qué ganas de pillarlas)

Roche LightCyler 480

estos de las casas comerciales están cada vez peor.... no, no es la nueva película de pixar...

ChIP y más

Bueno, pues ya he hecho mi primera ChIP en España, y estoy contenta porque ¡¡Me ha salido!!! jejejeje... la verdad es que estoy muy contenta porque cambiaban muchas cosas y no las tenía yo todas conmigo, pero vamos... que salió. Y aquí os dejo para vuestras risas y deleite la última "frikez" de los de BioRad. Hace un tiempo os puse la canción que le habían dedicado a la PCR. Pues bien, esta es la segunda parte. Lo peor de todo es que una va navegando por el youtube y ve cada cosa...

al fin resultados

Hola a todos, hoy escribo mucho más contenta, y es que al fin, despues de casi 3 años, estoy obteniendo resultados de mi tesis, que entre que me han entretenido con otras cosas y demás...
La ChIP que hice en EEUU (ahora ya sabeis lo que es la ChIP, jejeje) está dando sus frutos y ya estoy obteniendo algunas secuencias nuevas. Además estoy trabajando ahora con fósforo radiactivo, marcando ese mismo ADN, y aunque eso sí que son resultados muy preliminares y tendré que repetirlo, parece que va saliendo y que no da tantos problemas cómo acostumbra. Así que quería compartir mi alegría con vosotros, que una ya empezaba a agobiarse con eso de ver cerca el final de la beca. Este mes ya estoy de contrato, lo que significa que tengo ya sólo dos años. Para los que no esteis puestos las becas pre-doctorales, ahora mismo, son dos años de beca y dos de contrato. Fue un gran avance ya que esos dos años de contrato ya cotizas y luego tienes derecho a paro y demás... bueno pues eso, era sólo compartir mi esperanza

hasta las narices de las falacias informativas

El otro día viendo el telediario ví la noticia de la manifestación contra los transgénicos que hubo en Zaragoza y me revolví en el sofá sólo de oir lo que decían, al final tuve que cambiar de cadena a media noticia... El caso ya rozó lo irrazonable cuándo ví a gente quejarse porque quería tener un cultivo ecológico y se lo había contaminado el del campo de al lado que había puesto el cultivo transgénico porque "no se puede controlar dónde va el polen". ¡¡¡¡Por favor!!!! Informese un poquito antes de hablar! Una de las condiciones imprescindibles que tiene que cumplir un transgénico para salir al mercado es que el polen sea estéril, precisamente para evitar estos problemas de contaminación al medio. Por eso mucha gente se queja de que claro, que las semillas que producen no son fértiles.. es que si se cae la semilla al campo de al lado y crece también lo contaminaría... En fín, que si os interesa el tema hacedmelo saber y os busco y explico los requisitos que deben cumplir los transgénicos, pero, por favor, no os creais lo que dicen en la tele. PD.- si alguien sabe una forma sencilla (que con el html no me aclaro) para conseguir que esto me respete los puntos y a parte, lo agradecería

looking for the anther

Ya que las anteras me están quitando tanto tiempo y casi no puedo escribir aquí, he decidido mostraros a todos cómo es lo que estoy haciendo. Mi día comienza en el invernadero, dónde tenemos unas 300 plantas de distintas líneas y variedades. Aquí tenemos que ir planta por planta mirando a ver cómo es el tamaño de las espigas para ver las que están en una etapa propicia para cogerlas. Las espigas que nosotros queremos son aún pequeñas y no asoman por encima de las hojas, están aún dentro, de modo que hay que ir tocando los hijuelos para notar su posición y tamaño. Es un engorro porque son muchas plantas y además algunos días crecen mucho de un día para otro. Luego cortamos esos hijuelos y los llevamos al laboratorio en una botella de agua. Por supuesto etiquetamos el nombre de cada planta, porque como ya os digo tenemos muchas líneas y variedades distintas. Esa foto que os he puesto era de un día en que por suerte teníamos poco.... Luego hay que abrir la hoja del hijuelo y ahí está la espiguita, como veis aún es pequeña, pero ese es el tamaño que nosotros andamos buscando. De hecho esta era un poco grande, pero para enseñaroslo es más fácil así. Cogemos la espiga y la colocamos en una placa Petri con papel de filtro húmedo para que no se seque y ahí, debajo de la lupa binocular, es dónde vamos a abrir las flores para ver las anteras. Hay algo que nos facilita un poco la búsqueda, y es que las espigas tienen un gradiente de maduración, de manera que las flores que hay en el centro de la espiga están más maduras y las que hay hacia los extremos progresivamente menos maduras (o al menos en teoría porque a veces hacen lo que les da la gana). Las fotos que os muestro a partir de ahora no están tan bien, pero es que las hice a través del ocular de la lupa con mi cámara, porque no tenemos cámaras de fotos acopladas a las lupas, así que siento lo del círculo rodeado de negro. En esta se ve la espiga más de cerca (cuando se mira directamente el campo es más amplio y es más fácil). Se ven cada una de las "cosas" a los lados de la espiga, y digo "cosas" porque aunque se podría pensar que son flores realmente son inflorescencias, porque ahí, en cada una, hay 3 o 4 florecitas. En esta imagen he abierto la inflorescencia, de modo que ha quedado una flor a la derecha, otra a la izquierda y otra en el centro. Como veis crecen como si estuvieran unas dentro de otras, y la de más afuera es más madura, la siguiente de más adentro un poco menos y la de más adentro menos. Esto también ayuda a saber un poco qué flor es la que andamos buscando. Luego, cuándo abres la flor y le quitas los pétalos (que en gramíneas se llaman glumas) te encuentras con las 3 anteras (partes de la flor dónde se forma el polen) y el gineceo (parte de la flor que recibe el polen y dónde se forman las ovocélulas). Lo que nosotros queremos son las anteras, puesto que, como en todo ser vivo, la meiosis masculina es más fácil de estudiar que la femenina. Como cada flor tiene 3 anteras y se supone (que luego no siempre) que son sincrónicas (es decir, que todas han crecido a la vez y están en la misma fase), cogemos una de las anteras de la flor, la teñimos y la "espachurramos" entre un porta y un cubre para mirar las células al microscopio, y si están en la fase que queremos guardamos las otras dos anteras en fijador para los experimentos, y si no las tiramos. Pues en esto me paso los días desde hace ya casi un mes... y no se lo que me falta pero espero que no mucho porque mi espalda, mis ojos y mi paciencia ya no se si dan para mucho más. Bueno, para que veais que el trigo sí tiene flores (aunque son muy feas) y entendais un poco más a qué me dedico. Ya me contareis qué os parece... besos

sin vacaciones

Y es que las plantas no entienden de fiestas ni días de guardar... Ya podrían pero no.... Yo entiendo que a las plantas no les ponen un calendario, y entonces se guían por el fotoperiodo y los ciclos lunares, y claro, como la Semana Santa también va conforme a los ciclos lunares, pues me quedo sin vacaciones, porque mis plantas siempre están en la época idónea para ser recogidas en Semana Santa.... Y es que tengo el trigo formando polen a más no poder, y cómo yo necesito esa división que luego da lugar al polen... pues a quedarse sin vacaciones. Lo peor no es eso, es tener que venir tooodos los días y pasarse las horas entre lupa y microscopio... y claro, tengo la espalda... pero bueno. Por todo ello os digo que intentaré sacar tiempo para escribir, pero no puedo prometer nada... Pasad buenas vacaciones los que podais...